ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลางและยาเพิ่มสมรรถนะทางสมอง (nootropic drugs) มันทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในเคมีเฮเทอโรไซคลิก เนื่องจากวงแหวนไอโซซอกซาโซลมีความตอบสนองสูง ทำให้สามารถปรับแต่งสำหรับการพัฒนายา ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการเพิ่มสมรรถนะทางปัญญาหรือปกป้องเซลล์ประสาท กลุ่มเอสเตอร์ของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม