ใช้เป็นสารเคมีกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะยาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง เนื่องจากมีกลุ่มคลอโรและเอสเตอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ซึ่งช่วยให้สามารถปรับโครงสร้างเพิ่มเติมได้ หมู่ไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มความชอบไขมันและความคงตัวทางเมแทบอลิซึม ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาส่วนประกอบที่ใช้งานที่มีความคงตัวในสิ่งแวดล้อมและประสิทธิภาพที่ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในเคมีภัณฑ์ป้องกันพืชสำหรับการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีฐานเป็นพิริมิดีน