ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาและสารเคมีละเอียด ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการก่อตัวของสารประกอบเฮเทโรไซคลิกผ่านปฏิกิริยาการเกิดวง (cyclization reactions) ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยา cross-coupling ที่มีตัวเร่งปฏิกิริยาพาลลาเดียม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki และ Heck เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้เกิดการเปลี่ยนแปลงแบบเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อน รวมถึงสารชีวภาพและวัสดุฟังก์ชันนัล