ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนหน้าที่ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากธรรมชาติที่อิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ของวงแหวนธิโอฟีน ใช้กันทั่วไปในห้องปฏิบัติการวิจัยสำหรับการสร้างอนุพันธ์ที่อิงธิอีนิลใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่อาจเกิดขึ้น