ใช้ในงานวิจัยชีวโมเลกุลโดยเฉพาะในการติดฉลากหรือจับโปรตีนเป้าหมายผ่านเทคนิคที่เรียกว่า APEX tagging ซึ่งช่วยระบุตำแหน่งและปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนภายในเซลล์ได้อย่างแม่นยำ เนื่องจากสารนี้สามารถทำปฏิกิริยากับเพอร์ออกซิเดสและไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์เพื่อสร้างอนุมูลอิสระที่จับกับโปรตีนใกล้เคียงได้ หลังจากนั้นสามารถดึงโปรตีนที่ถูกจับด้วยสเตรป์ทาไวดินเพราะมีโครงสร้างคล้ายไบโอทิน แต่สามารถแยกตัวออกจากสเตรป์ทาไวดินได้ง่ายโดยไม่ทำลายโปรตีน ทำให้เหมาะกับการวิเคราะห์โปรตีนด้วยมวลสเปกโตรเมตรีหรือเวสเทิร์นบลอตติ้ง