ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาแก้ระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) และการรักษาโรคเมแทบอลิซึม โครงสร้างไซโคลเฮกซานที่มีฟลูออรีนสองตัวที่ตำแหน่ง 3-3 ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาโรคในการปรับปรุงยาที่มีศักยภาพ มักนำเข้าไปในโมเลกุลขนาดเล็กที่ต้องการคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้นและความเลือกสรรเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่มีความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น