ใช้หลักๆ เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญที่มีฟลูออรีน (APIs) ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ หมู่บรอมโมเมทิลของมันช่วยให้เกิดการจับคู่กับนิวคลีโอไฟล์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตรสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีความจำเพาะต่อเป้าหมายที่ดีขึ้นและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม การมีทั้งหมู่ฟลูออรีนและเมทอกซีช่วยให้ปรับแต่งคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ในสารประกอบสุดท้ายได้