ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในโมเลกุลยา นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากช่วยเพิ่ม lipophilicity และการทะลุผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นิยมใช้ในเคมีเภสัชสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ที่เกี่ยวข้องกับกรดคาร์บอกซิลิกอะโรมาติก