ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช ความตอบสนองของสารนี้ช่วยให้สามารถนำกลุ่มฟังก์ชันพื้นฐานพิริมิดีนเข้าไปในโมเลกุลขนาดใหญ่ ส่งเสริมกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาเภสัชกรรมที่ต้องการโครงสร้างพิริมิดีนคลอรีนสำหรับการออกแบบยา โดยเฉพาะยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง ใช้กันอย่างแพร่หลายในห้องปฏิบัติการวิจัยสำหรับการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกหรือปฏิกิริยาครอสคัปปลิ้ง