FLT3-IN-1 ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาและยับยั้ง receptor tyrosine kinase FLT3 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการเพิ่มจำนวนเซลล์และการรอดชีวิตของเซลล์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าในการศึกษามะเร็งเม็ดเลือดขาวเฉียบพลัน (AML) เนื่องจาก mutation ในยีน FLT3 มักเกี่ยวข้องกับมะเร็งชนิดนี้ นักวิจัยใช้เพื่อเข้าใจกลไกของเส้นทางสัญญาณ FLT3 และประเมินศักยภาพในฐานะเป้าหมายการรักษา นอกจากนี้ FLT3-IN-1 ช่วยในการพัฒนาการรักษามะเร็งใหม่โดยทำหน้าที่เป็นเครื่องมือทดสอบประสิทธิภาพของตัวยับยั้ง FLT3 ในงานวิจัยก่อนคลินิก การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการสำรวจกลไกการดื้อยาและการปรับปรุงกลยุทธ์การรักษาสำหรับมะเร็งที่ขับเคลื่อนโดย FLT3