สารเซโรโทนิน บี-ดี-กลูโครอนิเด ถูกใช้เป็นตัวชี้วัดทางชีวภาพในการศึกษาเกี่ยวกับการเผาผลาญของเซโรโทนินในร่างกาย โดยเฉพาะในกระบวนการกำจัดสารเคมีในตับ ซึ่งช่วยให้เข้าใจกลไกการขับถ่ายของสารสื่อประสาทในระบบประสาทส่วนกลาง สารนี้ยังมีบทบาทในการวิจัยด้านจิตเวชและการศึกษาความผิดปกติของอารมณ์ เช่น ภาวะซึมเศร้าและวิตกกังวล เนื่องจากการเปลี่ยนแปลงระดับของเมตาบอไลต์ของเซโรโทนินสามารถบ่งชี้ถึงความผิดปกติของการทำงานของสมอง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิเคราะห์ทางห้องปฏิบัติการเพื่อติดตามประสิทธิภาพของยาต้านซึมเศร้าบางชนิดที่มีผลต่อการเผาผลาญของเซโรโทนิน