ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบต้านจุลชีพ โดยเฉพาะสารต้านเชื้อแบคทีเรียและเชื้อรา เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง นิยมใช้ในงานวิจัยด้านยา เพื่อพัฒนาสารนำร่อง (lead compound) ที่มีเป้าหมายในการยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะในเซลล์เป้าหมาย เหมาะสำหรับการสร้างอนุพันธ์ที่มีความหลากหลาย โดยการเติมหมู่ฟังก์ชันอื่นเข้าไปที่ตำแหน่งของโบรมีนหรือคลอรีน ทำให้สามารถปรับปรุงฤทธิ์ทางเภสัชกรรมได้ มีการนำไปใช้ในสังเคราะห์สารกำจัดศัตรูพืชบางชนิด โดยเฉพาะสารกำจัดเชื้อราในพืช ซึ่งแสดงฤทธิ์ได้ดีในระดับต่ำ เนื่องจากมีหมู่ฮาโลเจนสองชนิด จึงสามารถใช้ในปฏิกิริยาแทนที่แบบเลือกได้ (selective substitution) ทำให้มีความยืดหยุ่นสูงในการออกแบบสารใหม่