สารเคมีนี้ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะ reagent พิเศษ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีน โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งมีกลุ่มเพอร์ฟลูออโรฟีนิล ทำให้มีคุณค่าต่อการนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งมีความสำคัญในเภสัชกรรมและเกษตรเคมีเพื่อเพิ่มความเสถียร ชีวเภสัชจลนศาสตร์ และความต้านทานต่อการเผาผลาญ นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในเคมียารักษาเพื่อสร้างยาที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง เพิ่มเติมคือ ไอออนเทตราฟลูออโรบอเรตช่วยเพิ่มความละลายและปฏิกิริยาในปฏิกิริยาอินทรีย์ต่างๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในงานวิจัยทางเคมีขั้นสูง