ใช้หลักๆ เป็นสารอัลคิลเรติ้งเอเจนต์ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ สารประกอบนี้มีคุณค่าสำหรับการนำกลุ่ม 2-เมทอกซีเอทิลเข้าไปในสารตั้งต้นต่างๆ โดยมักใช้ในการเตรียมสารกลางทางเภสัชกรรม ซึ่งฟังก์ชันเอสเตอร์ซัลโฟเนตช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการแทนที่ด้วยนิวคลีโอไฟล์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ เนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาของกรุ๊ปทอไซเลตที่เป็น leaving group จึงอำนวยให้เกิดการก่อตัวของพันธะ C–O, C–N และ C–C ภายใต้สภาวะอ่อนโยน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์พอลิเมอร์ที่ถูกฟังก์ชันนาไลซ์และสารซอร์แฟกแทนต์ ซึ่งโซ่เมทอกซีเอทิลช่วยเพิ่มความละลายและความเข้ากันได้ทางชีวภาพ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงสารเคมีเกษตรและสารเคมีพิเศษที่ต้องการโซ่ข้างที่เชื่อมด้วยเอเทอร์และมีขั้วไฟฟ้าที่ควบคุมได้