1-(2-Morpholinoethyl)-2-thiourea ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางที่หลากหลายในการเตรียมสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งประกอบด้วยหมู่ morpholine และ thiourea ทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา มักใช้ในการสังเคราะห์สารที่มีศักยภาพในการต้านมะเร็ง ต้านจุลชีพ และต้านไวรัส นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสร้างลิแกนด์สำหรับเคมีการประสานของโลหะ ช่วยในการศึกษากระบวนการเร่งปฏิกิริยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการค้นพบยาและการวิจัยทางชีวเคมี