ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการกลุ่มปกป้อง กลุ่ม tert-butyl carbamate (Boc) ให้ความเสถียรในระหว่างปฏิกิริยาหลายขั้นตอนและสามารถกำจัดออกได้อย่างเลือกสรรภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน แหวน tetrahydrothiopyran ให้โครงสร้างเฮเทอโรไซคลิกอิ่มตัวที่อาจเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมหรือมีอิทธิพลต่อการคอนฟอร์เมชันในตัวยา ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์