2-Amino(thiophene-5-d1) ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษากลไกการเกิดปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่ รูปแบบดีเทอเรตของสารนี้มีคุณค่าในงานศึกษาการติดฉลากไอโซโทป ซึ่งช่วยในการวิเคราะห์เส้นทางเมแทบอลิซึมและพฤติกรรมของยาในระบบชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่มีไธโอฟีน กลุ่มเอมีโน และการแทนที่ด้วยดีเทอเรียม ทำให้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับโมเลกุลยาใหม่ ๆ