(5-Fluorothiophen-2-yl)methanol เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เนื่องจากโครงสร้างของมันมีทั้งส่วนฟลูออรีนและไทโอฟีน ซึ่งเป็นกลุ่มฟังก์ชันที่มีประโยชน์ในการออกแบบและพัฒนายาใหม่ๆ สารนี้มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงยาที่มีฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย ต้านไวรัส หรือยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาวัสดุใหม่ๆ ในสาขาเคมีอินทรีย์และวัสดุศาสตร์ โดยเฉพาะวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษทางไฟฟ้าหรือแสง