เมทิล 4-คลอโรไธโอฟีน-2-คาร์บอกซิเลต ใช้หลักเป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี เป็นส่วนประกอบหลักในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างแหวนไธโอฟีนทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างสารที่มีคุณสมบัติบำบัด เช่น สารต้านการอักเสบ ต้านจุลินทรีย์ หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาเกษตรเคมี รวมถึงยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพและเพิ่มประสิทธิภาพ บทบาทในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการสร้างโพลิเมอร์เฉพาะและวัสดุสำหรับการใช้งานอุตสาหกรรม