ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการแข็งตัวของเลือดและยาต้านการอักเสบ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อนซึ่งพบในโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิและเฮ็ค เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโปรแกรมการค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากแกนเบนโซไทโอเฟนที่มีอิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ ซึ่งช่วยให้วัสดุมีคุณสมบัติการขนส่งประจุที่เพิ่มขึ้น