ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารยับยั้งตัวรับ (receptor antagonists) และสารยับยั้งเอนไซม์ (enzyme inhibitors) โครงสร้างของมันสนับสนุนการก่อตัวของโมเลกุลชีวภาพ โดยเฉพาะในการวิจัยที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติจากการอักเสบและความผิดปกติทางระบบประสาท ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชวิทยาเพื่อสร้างระบบเฮเตอโรไซคลิกที่ซับซ้อน เนื่องจากความตอบสนองทางเคมีของหมู่กรดคาร์บอกซิลิกและกลุ่มฮาโลเจน ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ (coupling reactions) และการสร้างอนุพันธ์ (derivatization) นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัล โดยที่อนุพันธ์ไทโอฟีนที่ถูกฮาโลเจนช่วยเสริมคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์หรือความเสถียร