ใช้หลักๆ เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร ความสามารถในการทำปฏิกิริยาของมันช่วยให้สามารถนำหมู่ 3-โบรโมไธโอฟีน เข้าสู่โมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพที่ออกฤทธิ์ มักใช้ในการเตรียมอนุพันธ์เบสไธโอฟีนที่แสดงกิจกรรมต้านจุลินทรีย์ ต้านเชื้อรา หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และวัสดุฟังก์ชันนัล เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ของวงแหวนไธโอฟีน หมู่อะซิลคลอไรด์ของมันช่วยให้เชื่อมโยงกับอะมีนหรือแอลกอฮอล์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมีบล็อกกิ้งสำหรับการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ