ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากมีอะตอมโบรมีนที่ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง โครงสร้างแกนไทโอฟีนมีส่วนช่วยในคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ที่เป็นประโยชน์ในเซมิคัณฑักเตอร์ออร์แกนิกและวิทยาศาสตร์วัสดุ ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยา Suzuki และ Stille เพื่อสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังพบการใช้ในงานวิจัยสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากโครงสร้างเฮเทอโรไซคลิกที่ถูกแทนที่ซึ่งสามารถโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ