ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ในเคมีเฮเทอโรไซคลิก ทำให้มีคุณค่าในการสร้างยาที่มีฐานเป็นไทโอฟีน ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงเพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยทางการแพทย์ และในการเตรียมเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากวงแหวนไทโอฟีนมีลักษณะอิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยที่โบรมีนทำหน้าที่เป็นหมู่ที่ออกจากสำหรับการแทนที่นิวคลีโอฟิลิก