ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานพัฒนายาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากหมู่ไอโซธิโอไซยาเนตมีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีน และกรดนิวคลีอิก ทำให้สารนี้เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสร้างสารอนุพันธ์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน รวมถึงใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบห่วง 5 หรือ 6 อะตอมที่มีกำมะถันและไนโตรเจน เช่น ไทอะโซล หรือไทอะดาซีน ซึ่งมีศักยภาพในการนำไปใช้ด้านเภสัชกรรม