5-Bromo-4-chlorothiophene-2-carboxylic acid ถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ ที่มีความสำคัญทางยาและวัสดุศาสตร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพและยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนายาเพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพของสารประกอบใหม่ๆ ซึ่งช่วยในการค้นพบยารักษาโรคที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น