แผ่นซิลิกาเจลใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในเทคนิคโครมาโตกราฟีแบบแผ่นบาง (Thin Layer Chromatography, TLC) ซึ่งช่วยในการแยกและระบุสารประกอบต่างๆ ในตัวอย่าง เนื่องจากแผ่นซิลิกาเจลมีคุณสมบัติในการดูดซับที่ดี ทำให้สามารถแยกสารที่มีความแตกต่างเล็กน้อยในโครงสร้างได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการตรวจสอบความบริสุทธิ์ของสาร การติดตามปฏิกิริยาเคมี และการวิเคราะห์สารประกอบในอุตสาหกรรมยา เคมีภัณฑ์ และอาหาร อีกทั้งยังมีการนำไปใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษาสารธรรมชาติและสารสังเคราะห์ต่างๆ ด้วย