ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เช่น การพัฒนายาต้านมะเร็ง หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท ด้วยโครงสร้างที่มีหมู่คลอโรเมทิลและวงแหวนไทโอฟีนที่เชื่อมกับพิริไมดีนอน ทำให้สามารถทำปฏิกิริยากับสารอื่นได้ง่าย จึงเหมาะสำหรับการสร้างอนุพันธ์ใหม่ในห้องปฏิบัติการ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาการถ่ายโอนกลุ่มฟังก์ชันและการจัดเรียงของโมเลกุล