ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสสำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถปรับแต่งได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างการบำบัดแบบมีเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการออกแบบเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากแกน thienopyrimidine ที่ขาดอิเล็กตรอน นิยมใช้ในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนในงานค้นพบยาและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์