5-(Boc-amino)thiazole ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มีโครงสร้าง thiazole ซึ่งเป็นที่รู้จักในคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ต้านการอักเสบ และต้านมะเร็ง กลุ่มป้องกัน Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์ที่ซับซ้อน ทำให้มีคุณค่าต่อเคมีเปปไทด์และเคมีเฮเตอร์โรไซเคิล การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบและปรับปรุงผู้สมัครยา