2-Methoxy-5-methyl-1,3,4-thiadiazole ถูกนำไปใช้หลักในภาคเกษตรกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารกำจัดเชื้อราและสารกำจัดวัชพืช มีบทบาทสำคัญในการปกป้องพืชผลจากเชื้อราต่างๆ และวัชพืชที่รบกวน ช่วยเพิ่มผลผลิตและคุณภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีเกษตรใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อม การประยุกต์ใช้ยังขยายไปยังอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายาที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้