ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดเชื้อราและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากมีกลุ่มโบรโมและไดฟลูออโรเมทิลที่ทำปฏิกิริยาได้ดี โครงสร้างของมันช่วยปรับเปลี่ยนฤทธิ์ทางชีวภาพในสารป้องกันพืชได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ โดยแกนไทอะไดอะซอลช่วยในการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยเพื่อสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่มีฟลูออรีน ซึ่งมีเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิกสูงขึ้น