เมทิลเททราซีน-NHS เอสเทอร์ใช้ในการติดฉลากทางชีวภาพ (bioorthogonal labeling) โดยเฉพาะในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีในระบบชีวภาพ เนื่องจากมีความสามารถในการทำปฏิกิริยาแบบคลิกเคมี (click chemistry) ที่รวดเร็วและเฉพาะเจาะจง มักใช้ในการติดฉลากโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน แอนติบอดี หรือเซลล์ เพื่อการศึกษาด้วยเทคนิคต่าง ๆ เช่น กล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์ หรือการถ่ายภาพทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาและการวิจัยทางชีวการแพทย์ เนื่องจากช่วยให้สามารถติดตามและวิเคราะห์โมเลกุลเป้าหมายได้อย่างแม่นยำในระบบที่มีความซับซ้อน