7-Fluoro-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline hydrochloride ถูกนำมาใช้หลักๆ ในการวิจัยและพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสารที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท โครงสร้างของมันมักถูกนำเข้าไปในโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อโต้ตอบกับตัวรับในระบบประสาทส่วนกลาง ทำให้มีคุณค่าในการสร้างการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับภาวะเช่น ภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และโรคพาร์กินสัน นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และการปรับตัวรับ ซึ่งช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่ๆ การแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับตัว ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในการออกแบบยา