ใช้หลักๆ ในการวิจัยและพัฒนายา สารประกอบ 5-คลอโร-1,2,3,4-เทตระไฮโดรไอโซควิโนลีน ไฮโดรคลอไรด์ นี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โดยอิงโครงสร้างไอโซควิโนไลน์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างสารประกอบที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยาต้านวิตกกังวล โครงสร้างพื้นฐานของมันยังถูกนำมาใช้ในการออกแบบยารักษาที่มีศักยภาพสำหรับโรคหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อผลิตสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งจำเป็นในเคมีเภสัช