สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพที่หลากหลาย รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ กลุ่มปกป้อง tert-butoxycarbonyl (Boc) มีบทบาทสำคัญในการคุ้มครองกลุ่มฟังก์ชันที่ทำปฏิกิริยาในระหว่างปฏิกิริยาเคมีที่ซับซ้อน ทำให้เกิดการแปลงเฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในเคมียารักษาเพื่อสร้างสารที่มีคุณสมบัติบำบัด คุณสมบัติโครงสร้างทำให้มีคุณค่าในการออกแบบตัวยับยั้ง ลิแกนด์ตัวรับ และตัวแทนชีวภาพอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ