กรดฟลูออโรแอนติโมนิกเป็นหนึ่งในกรดที่แรงที่สุดที่รู้จักกัน ใช้หลักในการวิจัยทางเคมีและเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการทางเคมีที่ซับซ้อน เนื่องจากมีความสามารถในการให้โปรตอนสูงมาก จึงมักใช้ในปฏิกิริยาที่ต้องการสภาพแวดล้อมที่เป็นกรดอย่างรุนแรง เช่น การแตกตัวของพันธะคาร์บอน-ไฮโดรเจน หรือการเกิดปฏิกิริยาไอออไนเซชัน นอกจากนี้ยังมีการศึกษาในการนำไปใช้ในกระบวนการผลิตสารเคมีเฉพาะทางและวัสดุขั้นสูง แต่เนื่องจากการใช้งานที่อันตรายและต้องควบคุมอย่างเข้มงวด จึงจำกัดอยู่ในห้องปฏิบัติการและงานวิจัยเป็นหลัก