อนุพันธ์ของอิโซไทอะโซลถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานอุตสาหกรรมและการเกษตรเนื่องจากคุณสมบัติการฆ่าเชื้อทางชีวภาพ พวกมันทำหน้าที่เป็นส่วนผสมหลักในสารฆ่าเชื้อเพื่อป้องกันการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ในระบบน้ำ เช่น หอระบายความร้อน โรงงานกระดาษ และของเหลวสำหรับงานโลหะ สารประกอบเหล่านี้ยับยั้งแบคทีเรีย เชื้อรา และสาหร่ายได้อย่างมีประสิทธิภาพ ช่วยควบคุมการเน่าเสียและรักษาความสมบูรณ์ของระบบ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารกันบูดในผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางและสี

ในด้านการเกษตร สารเคมีที่อิงจากอิโซไทอะโซลถูกใช้เป็นสารกันบูดและสารป้องกันในสูตรป้องกันพืช พวกมันช่วยยืดอายุการเก็บรักษาและป้องกันการปนเปื้อนจากจุลินทรีย์ในสารกำจัดศัตรูพืชและสารกำจัดวัชพืช

นอกจากนี้ โครงสร้างอิโซไทอะโซลยังสำคัญในการวิจัยเภสัชกรรม โครงสร้างของพวกมันปรากฏในสารประกอบที่มีกิจกรรมต้านจุลินทรีย์ ต้านการอักเสบ และต้านมะเร็ง ทำให้มีคุณค่าในการค้นพบและพัฒนายา