ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเป็นตัวทำปฏิกิริยาตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างซัลโฟไนล์ฟลูออไรด์ ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายาและสารชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มของโปรตีนหรือเอนไซม์อินฮิบิเตอร์ เนื่องจากหมู่ซัลโฟไนล์ฟลูออไรด์สามารถทำปฏิกิริยากับหมู่ไซส์ทีน หรือไฮดรอกซิลในโปรตีนได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้ถูกนำมาใช้ในการศึกษาเชิงชีวโมเลกุลและการออกแบบยารุ่นใหม่ นอกจากนี้ยังใช้เป็นรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาเคมีแบบคลิก (click chemistry) สำหรับการติดป้ายสารชีวโมเลกุลในงานวิจัยทางชีววิทยาและเภสัชวิทยา