ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานเป็นซัลโฟนาไมด์ มีบทบาทสำคัญในการผลิตโมเลกุลที่มีคุณสมบัติต้านแบคทีเรีย ต้านไวรัส หรือต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำกลุ่มไตรฟลูออโรมethoxy phenyl เข้าสู่โมเลกุลเป้าหมาย เพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือความเสถียรของโมเลกุล การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยสารเคมีเกษตร เพื่อสร้างยาฆ่าแมลงหรือวัชอุทิศชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้น เนื่องจากมีกลุ่มซัลโฟนิลคลอไรด์ที่ทำปฏิกิริยากับสารประกอบอื่นๆ เช่น อะมีนหรือแอลกอฮอล์ เพื่อสร้างพันธะซัลโฟนาไมด์หรือเอสเทอร์ซัลโฟนิก ซึ่งเป็นส่วนสำคัญในโครงสร้างเภสัชภัณฑ์