ใช้หลักๆ เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มีโครงสร้าง piperazine. กลุ่มฟังก์ชันซัลโฟนิลคลอไรด์ของมันทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับนิวคลีโอไฟล์ เช่น อะมีนและแอลกอฮอล์ ทำให้มีคุณค่าต่อการนำโครงสร้าง 4-เมทิลพิพีราซีนซัลโฟนาไมด์สแคฟโฟลด์เข้าสู่โมเลกุลที่ใหญ่กว่า โครงสร้างนี้พบได้บ่อยในยาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง สารต้านจุลชีพ และตัวยับยั้งไคเนส นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร และในการเตรียมตัวทำให้เกิดปฏิกิริยาพิเศษสำหรับการวิจัยเคมียารักษาโรค เนื่องจากความสามารถในการเพิ่มความละลายและชีวเภสัชจลนศาสตร์ในตัวสมัครยา