ใช้หลักๆ เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับอะมีนและแอลกอฮอล์ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างอนุพันธ์ซัลโฟนาไมด์และเอสเตอร์ซัลโฟเนต ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ รวมถึงยาต้านเชื้อรา ยาต้านแบคทีเรีย และยาต้านการอักเสบ การมีโบรมีนช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น Suzuki หรือ Heck ซึ่งช่วยให้สามารถ diversify อย่างรวดเร็วในการวิจัยเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีพิเศษที่ต้องการลิโพฟิลิกสูงและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม เนื่องจากมีหมู่ไตรฟลูออโรมอกซี