ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาตั้งต้น (intermediate) ในการสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิก โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารที่มีหมู่อะมิโนหรือไฮดรอกซิลได้ง่าย ทำให้สามารถสร้างซัลโฟนามายด์หรือซัลเฟตเอสเทอร์ได้ ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในสารออกฤทธิ์หลายชนิด นอกจากนี้ หมู่ไตรฟลูออร์เมทิลและโบรมีนบนวงเบนซีนช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ทางชีวภาพของสารที่สังเคราะห์ได้ จึงนิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนาสารใหม่ที่ต้องการคุณสมบัติเฉพาะด้าน เช่น สารต้านจุลชีพหรือสารปรับภูมิคุ้มกัน