ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตัวทำปฏิกิริยาสุลโฟนิเลชัน โดยเฉพาะในการเตรียมซัลโฟนาไมด์ที่มีกิจกรรมทางเภสัชวิทยา โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรรในการค้นพบยา โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ซึ่งเล็งเป้าไปที่เอนไซม์และตัวรับ การมีทั้งหมู่โบรโมและฟลูออโรรินช่วยให้สามารถทำหน้าที่เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษาโรค ใช้บ่อยในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งโปรติเอสและตัวยารักษาอื่นๆ โดยที่หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำหน้าที่เป็นเภสัชพอร์โฟร์หลัก นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีความเสถียรและกิจกรรมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้น