ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิก โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารชีวภาพ เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับหมู่อะมิโนหรือหมู่ไฮดรอกซิลได้ดี จึงนิยมใช้ในการสร้างพันธะกับสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ในการพัฒนายาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส หรือสารยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีวัสดุเพื่อสร้างสารที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารเรืองแสงหรือสารที่มีความเป็นขั้วสูง