ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิก โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารประกอบที่มีหมู่อะมิโนหรือไฮดรอกซิลได้ง่าย ทำให้สามารถสร้างซัลโฟนามายด์หรือซัลเฟสท์ได้ ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในสารออกฤทธิ์หลายชนิด นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารตั้งต้นสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อน