ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้สามารถเชื่อมต่อกับอะมีนหรือแอลกอฮอล์ สร้างซัลโฟนามายด์หรือเอสเทอร์ซัลโฟเนต ซึ่งเป็นโครงสร้างหลักในโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ ใช้บ่อยในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากช่วยเพิ่มลิโพฟิลิกและความเสถียรในส่วนประกอบออกฤทธิ์ขั้นสุดท้าย นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อสร้างยาตัวสมัครที่เป็นฐานซัลโฟนามายด์ที่มีศักยภาพต้านจุลินทรีย์หรือต้านการอักเสบ