ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับการยับยั้งเอนไซม์ เช่น เอนไซม์คาร์บอนแอนไฮเดรส ซึ่งเกี่ยวข้องกับโรคบางชนิด เช่น ต้อหิน และมะเร็ง โครงสร้างที่มีหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำให้สามารถทำปฏิกิริยากับสารประกอบอื่นได้ง่าย เช่น แอมโมเนียหรืออนุพันธ์ของแอมีน เพื่อสร้างซัลโฟนามายด์ที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในงานวิจัยด้านเคมีเชิงสร้างสรรค์เพื่อพัฒนาสารใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรค