ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานซัลโฟนาไมด์ซึ่งมีเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและไบโออวэйลบิลิตีที่เพิ่มขึ้น โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ที่มีประสิทธิภาพสูง โดยเฉพาะในยารักษามะเร็งและยาต้านการอักเสบ ซึ่งการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยปรับปรุงการจับกับเป้าหมายและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากกรอบอะโรมาติกที่แข็งและตำแหน่งของฮาโลเจน