ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับผลิตยา โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่มีโครงสร้างเป็นซัลโฟนามายด์ ซึ่งมีฤทธิ์ต้านจุลชีพและใช้รักษาโรคติดเชื้อต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยา (reagent) ในการสร้างพันธะซัลโฟนามายด์ในห้องปฏิบัติการและอุตสาหกรรมยา เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความไวต่อการเกิดปฏิกิริยากับแอมโมเนียหรืออะมีนได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างอนุพันธ์ของซัลโฟนามายด์ที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง